Department of Life Science, UOS

전임교수

Department of Life Science, UOS
부교수 / Ph.D. / 학과장
이동성 Dong-Sung Lee
  • OFFICE 2-217호 / 02-6490-2676
  • LAB 2-B134호 / 02-6490-5620
  • E-MAIL dslee@uos.ac.kr
  • RESEARCH 생명정보학, 후성유전학, 유전학, 단일세포
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연구소개

우리 연구실은 유전체, 후성유전체, 전사체 등을 다양한 시퀀싱 기술을 활용하여 연구하고 있습니다. Whole genome sequencing, RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, Hi-C seq, bisulfite-seq 등의 기술을 사용하여 실험과 분석을 수행하고, 더 나아가 새로운 기술 또한 개발하고 있습니다.

실험 방법 개발
우리는 single-cell multimodal 기술인 단일 핵 메틸 3C 시퀀싱 (snm3C-seq)을 개발하고 발표했습니다. 이 기술은 단일 세포에서 두 가지 이상의 특성을 동시에 관찰할 수 있게 해줍니다(Nature Methods 2019). 이 기술은 2019년에 Nature Methods에서 올해의 기술로 선정되었으며, 현재 뇌를 연구하기 위한 Brain Initiative에서 사용되고 있습니다.

분석 도구 개발
우리는 다양한 시퀀싱 기술에 대한 분석 방법을 개발하고 있습니다. 그 중에서도 우리는 Hi-C 시퀀싱을 사용하여 암 조직에서의 Structural Variations (SVs)를 연구하였으며, 유전체의 3차원 구조에서의 변화와 그 영향에 대한 연구결과를 2022년에 발표하였습니다 (Nature 2022).
또한, 이전에 개발한 snm3C에 대한 모든 기본 분석 파이프라인을 개발하였으며, 기본 분석을 위한 프로그램을 계속 개발하고 있습니다 (Nature Methods 2019).

학력

  • 2015 박사: 서울대학교 의과학과
  • 2010 학사: 고려대학교 생명유전공학과

주요 경력

  • 2020.09 – 현재 서울시립대학교 생명과학과 조교수
  • 2016.05 - 2020.08 Salk Institute for Biological Studies (Post-doc)
  • 2015.02 - 2016.05 서울대학교 의과대학 유전체의학연구소 연구원

주요 논문

  1. [2023.07] Hur J, Kim H, Kim U, Kim GB, Kim J, Joo B, Cho D, Lee DS*, Chung AJ. Genetically Stable and Scalable Nanoengineering of Human Primary T Cells via Cell Mechanoporation. doi: 10.1021/acs.nanolett.3c01720. Nano Letters
  2. [2022.12] Xu Z, Lee DS*, Chandran S, Le VT, Bump R, Yasis J, Dallarda S, Marcotte S, Clock B, Haghani N, Cho CY, Akdemir KC, Tyndale S, Futreal PA, McVicker G, Wahl GM, Dixon JR. Structural variants drive context-dependent oncogene activation in cancer. doi: 10.1038/s41586-022-05504-4. Nature
  3. [2023.05] Nam CH, Youk J, Kim JY, Lim J, Park JW, Oh SA, Lee HJ, Park JW, Jeong SY, Lee DS*, Oh JW, Han J, Lee J, Kwon HW, Kim MJ, Ju YS. Widespread somatic L1 retrotransposition in normal colorectal epithelium. doi: https://doi.org/10.1038/s41586-023-06046-z. Nature
  4. [2019.10] Lee DS*, Luo C*, Zhou J*, Chandran S, Rivkin A, Bartlett A, Nery JR, Fitzpatrick C, O’Connor C, Dixon JR, Ecker JR. Simultaneous profiling of 3D genome structure and DNA methylation in single human cells. doi: 10.1038/s41592-019-0547-z. Nature Methods.
  5. [2014.12] Lee DS*, Shin JY, Tonge PD, Puri MC, Lee S, Park H, Lee WC, Hussein SM, Bleazard T, Yun JY, Kim J, Li M, Cloonan N, Wood D, Clancy JL, Mosbergen R, Yi JH, Yang KS, Kim H, Rhee H, Wells CA, Preiss T, Grimmond SM, Rogers IM, Nagy A, Seo JS. An epigenomic roadmap to induced pluripotency reveals DNA methylation as a reprogramming modulator. doi: 10.1038/ncomms6619 Nature Commun